Действие разворачивается в альтернативной версии современной Японии, в небольшом городе Сугомори, жители которого постепенно покидают его из-за необъяснимых процессов, приводящих к упадку территории. Однажды обычный нелюдимый старшеклассник Кацухира Агато оказывается выбранным для участия в таинственной государственной программе, о которой он раньше не имел никакого представления.
